Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms