Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms