Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam83bQ0VBM2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam83bQ0VBM2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms