Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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