Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms