Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Neurl1bQ0MW30 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms