Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms