Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms