Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxc4Q08624 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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