Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms