Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms