Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad51Q08297 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51Q08297 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad51Q08297 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms