Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms