Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms