Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox4Q06831 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox4Q06831 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox4Q06831 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox4Q06831 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox4Q06831 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox4Q06831 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms