Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms