Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms