Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms