Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mex3cQ05A36 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms