Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Top1Q04750 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms