Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms