Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms