Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms