Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms