Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GscQ02591 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GscQ02591 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms