Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms