Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms