Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms