Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms