Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms