Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sec23aQ01405 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms