Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms