Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col1a2Q01149 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms