Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2bQ01097 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms