Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms