Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms