Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms