Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms