Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bop1P97452 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bop1P97452 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms