Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms