Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms