Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme1P97371 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms