Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shox2P70390 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms