Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms