Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad1P70340 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms