Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgif1P70284 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms