Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp7P70280 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms