Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chl1P70232 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms