Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hoxd13P70217 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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