Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms